Proteinkemi 2 - Amingrupps egenskaper

Alla Inga Spara

• Vilka egenskaper har gruppen (Aliphatic)? Aminosyrans sidokedja består endast av kol och väte. De är inte reaktiva, och är viktiga i hydrofobiska interaktioner.
• Vilka egenskaper har gruppen (Aromatic)? Sidokedjan innehåller en benzenring, vilket bidrar till stadga i proteinet. De är också fotoreaktiva och absorberar ljus. En av dem är inte reaktiv och deltar i hydrofobiska interaktioner.
• Vilka egenskaper har gruppen (Acidic)? Aminosyran har positiv laddning vid pH 7 och kan protonera. pKa värdet för dessa är kring 4.
• Vilka egenskaper har gruppen (Basic)? Aminosyran har negativ laddning vid pH 7 och kan depronotera. pKa värdena för dessa är 10.5 och 12.5.
• Vilka egenskaper har gruppen (Hydroxylic)? Sidokedjan innehåller en hydroxylgrupp, eller OH. Dessa deltar i vätebindningar.
• Vilka egenskaper har gruppen (Sulfur-containing)? Sidokedjan innehåller svavel S. Dessa liknar aminosyrorna med hydroxylgrupper, men S är inte lika elektronegativt. Dessa sidokedjor kan bilda disulfidbidningar.
• Vilka egenskaper har gruppen (Amidic)? Liknar Acidic aminosyror molekylärt. De har en NH2 grupp istället för där acidic har ett enkelbundet syre på sin sidokedja. Dessa aminosyror deltar i vätebindningar och kan fungera både som en svag syra och en svag bas.
• Vilka egenskaper har den speciella aminosyran (Histidin)? Trots att det är en basisk aminosyra, så kan den ha neutrala egenskaper nära neutralt pH.
• Vilka egenskaper har den speciella aminosyran (Prolin)? Trots att det är en alifatisk aminosyra och inte är reaktiv, så kan en hydroxilerad form av Prolin bidra till strukturen av kollagen i bl.a. skelett.

Alla Inga Spara