Proteiner

Alla Inga Spara

• Vad är proteiner? polymerer gjorda av aminosyrer som är ihoplänkade tillsammans mha peptidband
• Vilken riktning har proteiner? N-terminal till C-terminal
• Vad består ett protein av? alfa-kol, en amino- och karboxylgrupp som skapar peptidbanden, ett väte, en sidokedja (finns 20 st)
• Vad händer vid pH 7 för proteiner? både amino- och karboxylgrupperna blir joniserade
• vilka är de 4 vanligaste grupperna hos aminosyror (samt vilka sidokedjor har dom då) sura (karboxylgrupp), basiska (aminogrupp), oladdade polära (stora grupper av aminosyror som inte är elektriskt laddade men polariserade), icke-polära (ingen laddning, ingen polaritet)
• Vad får proteinet att vikas ihop i vattnet? entropi, bindningar och interaktion (elektrostatiska attraktioner, vätebindningar, van der Waals)
• hur veckas proteiner i vattenmiljö? hydrofobisk kärna i mitten som innehåller icke-polära sidokedjor, runtom finns de polära sidokedjorna
• vad beror begränsningarna på för hur ryggraden för hur protein kan vikas i 3D? storlek, sidokedjornas laddning
• Vilka två scenarion finns vid 3D vikning i cellen? spontana (interaktion mellan sidokedjorna), kräver assistans av chaperones
• Ge 4 exempel på vikningar hos ett protein alpha helix, beeta-sheet, kollagen, elastin

Alla Inga Spara