mRna processing

vart och när sker mRNA processing? i cellkärnan efter transkription, pre-mRNA processas till moget mRNA

vilka 3 steg går pre-mRNA igenom? 5´-capping av primära transkriptet, poly-adenylering av 3´-änden (polyA tail), splicing av introner

5´cap 7-metylguanosinkapsel länkar till 5´ änden, 5-5 trifosfatlänk, m7G-cap

funktion för 5´-cap skydd mot nedbrytning genom 5-3 exonukleaser, lättar bindning till ribosomen

hur sker 5´capping direkt efter transkriptionsstart, mha enzymet CBC som är bundet till CTD svansen på RNAP II

kodande sekvenser exoner

mellan liggande icke kodande sekvenser introner

splicing klipper ut introner och sammanfoga exoner

splicing steg 1 introner upptäcks av spliceosomen, protein+snRNA

hur känner spliceosomen igen introner? 5´ splice site, branch point med adeninbas A, 3´ splice site

vad kallas proteinerna och snRNA som bildar spliceosomen snRNP

splicing steg 2 olika snRNP binder till pre-mRNA, det är U1, 2, 4, 5, 6

U1 känner igen 5´ splice site

U2 binder via branch point och hjälper att placer A-basen

U4, 5, 6 bilda och aktivera fungerande spliceosomkomplex, U5 hjälper att hålla exonerna rätt för sammanfogning

vad markerar splicing siten GU på 5´, AG på 3´

splicing steg 3 -OH på branch point A angriper intronens 5´, bindningen bryts för intronen, 5´ änden kopplas till A basen med 2´-5´-fosfodiesterbindning

vad gör denna fosfodiester bindning? intronen bildar ögla med en svans, lariat

splicing steg 4 exoner kopplas ihop, fira 3´OH på första exonet angriper intronets 3´, intronet bryts ut, exon 1 och 2 binds med fosfatdiesterbindning, lariat frigörs

alternativ splicing alla exoner behålls ej, olika kombinationer av exoner kan bildas

vad händer efter splicing? 3´ änden klyvs, proteiner känner igen polyadenyleringssignalen AAUAAA, RNA klyvs en bit nedanför signalen

vad händer efter klyvning? poly A-polymeras lägger många A i nya 3´ änden, poly-A-svans bildas, proteiner binder till svansen och skyddar den

vad gör poly-A-svansen skydd från nedbrytning, ökar mRNA stabilitet, transport ur cellen, bidrar till translation

vad händer efter att mRNA nu har blivit ogen? kontrolleras, förberedes för transport ur cellen genom kärnporer, translateras i ribosomer

är genom storlek och antal protein kodande gener lika stora nej, varierar mellan organismer mer än storlekar

vad birdrar alternativ splicing med? liknande protein med olika aktiviteter

Klicka

Skriv

Lyssna

Spel

Skriv ut