gentisk kod proteinsyntes, translation

Alla Inga Spara

• hur mycket energi kräver proteinsyntes i en cell? upp till 90% av kemisk energi, atp, gtp
• triplett kodon för specifik aminosyra, bilar sekvens
• degenerering hos genetiska koder fler tripletter kan koda till samma aminorsyra
• vad är universiell med kodonerna? samma kod i alla livsformer, få undantag
• antalet kodoner totalt 64, 61 för aminosyror, 3 stoppkodoner
• vilka är stoppkodonerna UAA, UAG, UGA
• i vissa kodoner är den 3e basen irrelevant i och med att det kodar i alla fall till samma, vilka? Leu, Val, Ser, Pro, Thr, Ala, Gly, Arg
• vad har andra basen för betydelse? aminosyra typ, om andra är U aminosyran hydrofob
• vad varierar i kodoner som kodar till aminosyror som kodas av 2, 3, 4 3e basen är den som varierar
• vad är startkodonet AUG, met
• hur löses problemet om att det finns 61 kodon med inte 61 tRNA för antikodonen? de första 2 är strikt samma, den första antikodon basen ersätts med inosin och koppla till den sista kodon basen
• vad kallas denna variation? wooble basparning
• hur kan wooble ske? tRNA 3D struktur tillåter alternativ basparning
• vad kallas det att flera kodon kan koda för samma aminosyra? koden är degenererad
• vad är födelen med wooble? minimerar skador av tysta mutationer, protein skapas utan behov av 61 tRNA
• slutsatsen av degerering och wooble motstånd mot missense mutationer
• protein syntes steg för steg .
• 1. proteinsyntes aminosyra aktivering
• hur sker aminosyraktivering? 2 steg, enzymatisk, enzymer som används kallas aminoacyl-tRNA-syntaser
• steg 1 aminosyra reagerar med ATP, enzym överför AMP till aminosyrans karboxylgrupp, aminoacyl-AMP bildas på enzymet
• steg 2 aminoacyl-AMP komplex sitter på enzymet, enzymet binder till rätt tRNA, aminosyran esterbinder till tRNA, AMP släpps
• vad är det som gör att aminoacyl-tRna synteaserna känner igen rätt tRNA nukleotidpositioner i tRNA, för lika aminosyror kan lura enzymet men inte tRNA
• bakterieribosom 70S, stora subenheten 50S, lilla subenheten 30S
• eukaryot ribosom 80S, stora subenheten 60S, lilla subenheten 40S
• vad betyder S i ribosomernas namn? svedberg enheten, hur snabbt det faller ner vid centrifug, ju högre ju snabbare
• ribosom subenheter innehåller rRNA, vilka rRNA innehåller subenheterna i bakterier stor subenheten 5S, 23S rRNA, lilla subenheten 16S rRNA
• vilka innehåller eukaryota? stora subenheten 5s, 28s, 5.8s, lilla subenheten 18s rRNA
• hur binder aa-tRNA till ribosomen A, P, E säten, urgröpningar
• vad står APE säten för? aminoacyl, peptidyl, exit
• vart sätter tRNA sig vid initering P sätet
• initiering placera mRNA och rätt initiator-tRNA i ribosomen
• initieringsfaktorer bakterier IF1, 2, 3
• steg 1 initiering lilla subenheten binder till IF, IF3 hållen subenheterna isär, IF1 organisera initieringskomplexet och hindrar tRNA-bindning till A-sätet
• steg 2 initiering hitta till rätt plats i ribosomen, 16s rRNA binder Shine dalgarno sekvensen för att positioner AUG rätt
• Shine–Dalgarno-sekvensen purinrik (A, G) område uppströms om startkodon
• vad fungerar Shine–Dalgarno-sekvensen som bindningssite för ribosomen
• steg 3 initiering initator-tRNA binder till startsäte, tRNA(fmet), UAC
• skillnad mellan tRNA(fmet) och tRNA(met) fmet bara i start, met när AUG förekommer under elongation
• steg 4 initiering IF2 binder GTP och hjälper till att välja och positionera initiator tRNA
• steg 5 initiering 50s subenheten ansluter sig till 30s komplexet, GDP och IF1, 2, 3 släpps ut, initiering-tRNA i p-säte, A-säte redo
• vad har bildats efter denna process 70s initieringskomplex, positionerar mRNA rätt
• elongering .
• vilka är elongeringsfaktorerna? EF-Tu, Ts, G
• steg 1 elongering nytt aminoacyl-tRNA kommer, EF-Tu binder ATP, EF-Tu-ATP binder aa-tRNA, tRNA till A-säte, rätt kodon kontrolleras, GTP blir till GDP och Pi, EF-Tu-GDP lämnar
• hur kan EF-Tu återanvändas trots undet GDP EF-Ts får GDP att släppa och GTP att binda till EF-Tu, den byter ut GDP och GTP utan hydrolis
• steg 2 elongering 23r rRNA i 50S katalyserar peptidbindning mellan aminosyror, kallas peptidyltransferas, p-säte tRNA släpper sin aminosyra till A-säte
• steg 3 elongation translokering, EF-G binder till ribosomen med GTP, GTP hydrolyseras, tRNA med kedja flyttad till P-säte, obelastad tRNA till E-säte och lämnar, A-säte ledig
• terminering .
• vad händer när stoppkodon nås? release factor, RF, upptäcker de
• steg 1 terminering RF1 känner igen UAA, UAG, RF2 känner igen UAA, UGA, vid A säte hjälper RF ribosomen att terminera
• steg 2 terminering RF1, 2 stimulerar hydrolys av peptidkedja, bryter bindningen mellan den och tRNA i p-säte med vatten, peptidkedja frigörs
• steg 3 terminering RF3 binder GTP och släpper ut RF1, 2 från ribosomen, GTP hydrolyseras och process avslutas
• steg 4 terminering ribosom återvinns med RRF, EG-G, IF3
• skillnad mellan bakterier och eukaryoter, varför är bakterier mkt snabbare? prokaryoter har ingen cellkärna, mRNA kan translateras direkt, även under transkription
• vad kallas mRNA som samtidgt används av flera ribosomer för proteinsyntes? polysom
• antibiotika hämmar proteinsyntes i bakterier, genom att rikta sig till ribosom, tRNA bindning, translokering osv

Alla Inga Spara