Cellens byggstenar: nukleotider

Alla Inga Spara

• DNA deoxyribonukleinsyra
• hur basparar sig dna? G-C, A-T
• vilka två typer av kvävebaser finns? puriner, pyrimidiner
• puriner dubbelring, en sexledad, en femledad
• vilka är puriner? adenin, guanin
• hur skiljer man på adenin och guanin? guanin har ett dubbelbindat syre
• hur är pyrimider formade? en sexledad ring
• vilka är pyrimidiner cytosin, uracil (RNA), tymin (DNA)
• hur binder kvävebaserna till varandra? purin-pyrimidin, vätebindningar
• varför är bindningen mellan G-C starkare än mellan A-T/U? 3 vätebindningar respektive 2 vätebindningar
• kvävebas+pentos nukelosid, N-länkad glykosidbindning
• nukelosid+pyrofosfatsvans nukleotid
• nukelinsyror polymer av nukleotider, bind med fosfodiesterbindningar
• vad är skillnaden mellan DNA och RNA? gruppen kopplad på pentosens 2´
• vad har dna/rna på 2´ DNA har en H, RNA har en OH
• vilken fördelaktighet ger den skillnaden mellan DNA/RNA DNA mer stabil, OH gruppen kan ingå i nukleofila attacker
• vad gör -OH gruppen med RNA? spontana RNA hydrolys uppstår, OH agerar nukleofilt mot fosfatgrupp, instabilt
• vad kallas bryggan som håller nukleinsyrorna? pentos-fofast backbone
• egenskaper för pentos-fosfat backbone negativt laddad, skyddar från nukleofila attacker, veckar syrorna
• hur är DNA fomrad högervriden dubbelhelix, antiparallel 5´ till 3´
• lilla skåran minor grove
• stora skåran major grove
• hur fick DNA just denna struktur? vätebindningar, hydrofob effekt, base stacking, elektrostatisk interaktion
• hur funkar hydrofob effekt i detta fall? fosfat hydrofil, kvävebaser hydrofob, kvävebaser vrider sig in
• base stacking van der waals krafter mellan kvävebaserna staplade
• elektrostatisk interaktion fosfat repellerar fosfat, strukturen hålls stadigt
• finns olika fromer av DNA, vilken är vanligast B-DNA
• vänstervridet ovanligt DNA Z-DNA
• DNA likt B-DNA men mindre vanligt A-DNA
• vad beror formen av DNA på? vatten, joner, proteiner i omgivning, nukleotidsekvens
• hur packas DNA? hårt för lagring, löses upp för avläsning
• vad lindas DNA runt? histoner
• vad kallas histoner+DNA virvad runt den? nukleosom
• vad händer med nukleosomerna? packas dynamiskt till kromatin
• löst packat kromatin eukromatin
• tätt packat kromatin heterokromatin
• hur packas kromatin ut för läsning av info ATP driver upppackning aktivt
• hur för man in ändringar i kromatin? genom kemisk modifiering av histoner
• vilka kemiska modifieringar finns det? acetylering, metylering, fosforylering
• hur lindar/klumpar DNA sig runt histoner? histoners positiva svansar, lysin och arginin, nukleosomer och DNA klumpas
• hur funkar actylering av histoner för att packa upp kromatin lysin/arginin positiv laddning minskar, DNA repellerar och blir återkomlig
• Hårtpackat dna inför celldelning kromosomer
• antal kromosomer 46 totalt, 22 par autosomala, 1 par könskromosomer
• ärvbar förändring av genuttryck utan förändrad DNA sekvens epigenetik
• exempel på epigenetisk förändring barn av svältande mödrar har annorlunda metabolism
• var sker epigenetisk förändring histonsvansarna
• RNA typer mRNA, rRNA, tRNA
• mRNA transkription av DNA, går ut till cytoplasma
• rRNA RNA i ribosomen där aminosyror sätts ihop, proteinkomplex
• tRNA en aminosyra och tre baser som känner igen kodon
• dubbelsträngat RNA dsRNA
• varför är dsRNA begränsat stort? pga 2´ OH

Alla Inga Spara